Санэпидслужба города Корсакова была организована 14 сентября 1946 года приказом № 71 по горздравотделу. В структуру службы того времени, с 1946 по 1953 год входили санитарно-гигиенический отдел, эпидемиологический отдел, пищевая лаборатория, дезбюро, санитарно-контрольный пункт. В штатном расписание числилось 27 сотрудников.
В 1948 году приказом Тихоокеанского Сахалинского Водздравотдела создаётся санитарно-эпидемиологическая станция порта Корсаков, в структуру которой до 1955 года входили бактериологическая лаборатория, дезотделение, санитарно-противоэпидемический отдел и морская карантинная станция, переименованная в 1950 году в санитарно-карантинный отдел.
Период создания санитарно-эпидемиологической службы, когда ведущим направлением работы была борьба с инфекционными заболеваниями, выпадает на 1947 - 1950 годы.
